如何制作一个列/向量，根据另一个向量的身份按顺序对行进行排序电阻

问题描述

我有一个包含所有外显子和外显子所属基因的数据框。 当前的外显子名称并不表示它们的顺序。 我已经根据起始基因组位置对它们进行了排序， 所以现在我只需要生成一个列，根据基因给他们一个订单号。

数据框顶部的示例：

基因外显子

GENE1,"789",
GENE1,"953","102",
GENE2,"43024",
GENE3,"542","047",

所以这就是我希望我的数据框的样子：

GENE EXON 基因组顺序

GENE1,1

GENE1,2

GENE1,3

基因 2,1

GENE3,2

如何制作一个列，根据另一个向量的身份按顺序对行进行排序。

解决方法

您可以使用 ave

尝试以下代码

transform(df,Order = ave(1:nrow(df),GENE,FUN = seq_along))

,

在data.table

library(data.table)
setDT(df)[,Order :=  rowid(GENE)]