问题描述
我有一个关于基于集群的熵计算的问题。 每个簇由蛋白质轨迹的 kmeans 计算。 问题是找到一个集群的熵 S_i，因为总 熵 S 是通过 S = \sum S_i * (N(i)/N) 找到的，其中 N(i) 是 第 i 个簇中的帧数，N 为总帧数。
对于第 i 个簇的熵：我可以假设 S_i = -k_B * [ln(p)] （=ln(p) 的预期值）？根据维基百科，这与 ln(variance) 成正比。 我假设每个集群都是高斯分布的。我可以计算任何原子的方差，将所有这些加起来并将其代入公式中（因为高斯的总和是高斯的）？
谢谢！
解决方法
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