问题描述
各位。
我刚刚开始学习如何分析 RNAseq 数据。
我在最开始的步骤中遇到了一个非常基本的问题。我试图在 R 上创建一个 Seurat 对象，但它一直失败。
HC2.data
10X 数据包含多种类型，并作为包含每种类型矩阵的列表返回。
HC2
CreateAssayObject 中的错误（计数 = 计数，min.cells = min.cells，min.features = min.features）： 输入矩阵中不存在单元格名称（列名）名称
我认为我们必须为我的数据框提供列名。我有如下两列。
名称(HC2.data)
[1]“基因表达”
[2]“复用捕获”
但是，没有如下列的名称。
列名(HC2.data)
空
接下来，我尝试根据网站 (https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/colnames.html) 编写此命令
colnames(HC2.data,do.NULL = FALSE)
[1] "col1"
我也尝试过使用此命令，正如之前 (https://github.com/satijalab/seurat/issues/1650) 与我遇到相同问题的人所推荐的那样。
colnames(counts)
is.data.frame(x) 中的错误：找不到对象“计数”
这是我所做的。我还不熟悉R。你们能帮我创建Seurat对象吗？
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！
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