问题描述
在我们的数值软件中,我在升级集群后遇到了一个奇怪的错误。 即:
At line 501 of file /home/weser/code/neci/src/fcimc_helper.F90 (unit = 6,file = '/dev/null')
Fortran runtime error: End of record
在我们的程序中,所有非根 MPI 进程的 STDOUT 关闭并重新打开以写入 /dev/null
。
(除了在调试模式下,每个非根 MPI 进程的 STDOUT 都被重定向到一个单独的文件。)
我试图为这个问题创建一个最小的例子,看起来像这样:
program stdout_to_dev_null
use iso_fortran_env,only: stdout => output_unit
use mpi_f08 ! also works with plain mpi
implicit none(type,external)
integer :: rank,n_procs,ierror
integer,parameter :: root = 0
call MPI_INIT(ierror)
call MPI_COMM_SIZE(MPI_COMM_WORLD,ierror)
call MPI_COMM_RANK(MPI_COMM_WORLD,rank,ierror)
if (rank /= root) then
close(stdout,status="keep")
open(stdout,file="/dev/null",recl=8192)
end if
write(stdout,*) 'Size is ',n_procs
write(stdout,*) 'node',': Hello world'
block
integer :: i
character(:),allocatable :: large_string
allocate(character(len=5000) :: large_string)
do i = 1,len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout,*) large_string
end block
call MPI_FINALIZE(ierror)
end program
问题在于,这个最小的示例完全按预期运行,使用 mpirun
手动运行时,以及像其他繁重计算一样实际发送到集群时。
现在我有三个问题:在关闭和重新打开 STDOUT 时,我在这样的代码中是否有未定义的行为,并且在最小的示例中我很幸运? /dev/null
中怎么会有记录结束?我该如何正确解决这个问题?
解决方法
这个问题与 MPI 无关,也与集群的差异无关。¹
这是有问题的代码,在 gfortran
下失败,但在 ifort
下工作完全靠运气。
如果文件以固定记录长度 (recl=...
) 打开,则写入语句不得超过此长度,即使输出转到 /dev/null
。
解决方法只是不以固定的记录长度打开并省略 recl=...
参数。
显然,ifort
的运行时库更加宽松,甚至在写入对象的字节长度大于 open
语句中指定的记录长度时也能工作。
在以下示例中,最后一个 write
语句在 gfortran
下失败。
program stdout_to_dev_null
use iso_fortran_env,only: stdout => output_unit
implicit none(type,external)
integer,parameter :: rec_length = 10
write(stdout,*) 'asdf'
close(stdout,status="keep")
open(stdout,file="/dev/null")
block
integer :: i
character(:),allocatable :: large_string
allocate(character(len=rec_length - 1) :: large_string)
do i = 1,len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
write(stdout,*) large_string
deallocate(large_string)
allocate(character(len=rec_length + 1) :: large_string)
do i = 1,*) large_string
end block
close(stdout,file="/dev/null",recl=rec_length)
block
integer :: i
character(:),len(large_string)
large_string(i : i) = 'A'
end do
! The following statement fails
write(stdout,status="keep")
end program
¹ 对于这个问题,新旧集群之间的相关区别在于,我们在新集群上使用 gfortran + OpenMPI
,在旧集群上使用 ifort + IntelMPI
。