如何在不退出远程服务器上的 R 的情况下恢复 X11 连接

问题描述

简短版本：在远程机器上工作时，如何从 R 中重新启动丢失的 X11 连接？

长版：

1. 设置

我使用 Mac 11.1 并连接到远程 Linux 服务器以在 R 中编写代码（通过 Nvim-R）。我使用的步骤通常是：

ssh -Y [e-mail]
screen -r my_R_work_session
conda activate my_environment
nvim code.r

然后键入 \rf 命令以在 nvim 中打开 R 终端。

然后我可以在 R 中绘制任何内容（例如，使用 plot(iris)）。该图会在我的 Mac 上的外部窗口（通过 X11 / XQuartz）中弹出。它通常在开始时工作正常。

2. 问题

但在某些时候，我可能会失去与服务器的连接一秒钟（互联网故障，vpn 停止......），当我恢复与服务器的连接时，一切似乎都正常（main {{ 1}} 连接）X11 连接除外。

此时，任何 ssh 的输出将是：

plot(iris)

3. 解决方案（但要寻找更好的方法！）

我目前找到的唯一解决方案是启动到服务器的新 ssh 连接，然后重新执行整个过程，直到启动 R 会话并绘制内容。有时，仅关闭 Error in .External2(C_X11,d$display,d$width,d$height,d$pointsize,: unable to start device X11cairo In addition: Warning message: In function (display = "",width,height,pointsize,gamma,bg,: unable to open connection to X11 display '' 会话有效，但我仍然需要重新加载 screen 和我的 conda 会话。但这很耗时（而且很烦人），我猜可能有更好的解决方案。

4. 我也尝试过（但没有改变任何东西）

我发现很多帖子都在用谷歌搜索这个错误，但仍然没有可以解决这个问题。

- 检查 R

在失去 X11 连接之前，capabilities() 的输出为：

capabilities()

在失去 X11 连接后，唯一的区别是 jpeg png tiff tcltk X11 aqua TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE FALSE http/ftp sockets libxml fifo cledit iconv TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE NLS profmem cairo ICU long.double libcurl TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE 被设置为 X11。

- 检查 FALSE

参考 this post，我检查了 DISPLAY，但似乎一切正常。 在终端中（在启动 R 之前或在 r 运行时）：

DISPLAY

在 R 中：

> echo $DISPLAY
localhost:10.0

我尝试设置 > Sys.getenv("DISPLAY") localhost:10.0 但没有任何区别。

- Sys.setenv("DISPLAY"=":0.0")

This post 建议将 X11UseLocalhost 中的 X11UseLocalhost no 更改为 X11UseLocalhost yes，但这对我没有任何影响。

- /etc/ssh/sshd_config

最后，我按照 this post 的建议（可能是最有希望的）尝试使用 Xpra，但也没有任何区别。虽然在这里我不确定我是否正确使用它。这是我所做的：

Xpra

非常感谢您的任何评论和帮助！

解决方法

对于遇到这篇文章的任何人，我最终找到了一个超级简单的解决方案：您只需要在当前会话的同时启动一个新的 ssh -Y 连接。然后可以将当前会话中的 DISPLAY 参数重定向到新连接中的值。

这里有一个更详细的例子。 在当前会话中（在开始新的 ssh 连接之前），如果您在 R 终端中尝试：

> capabilites()             # returns X11 = FALSE 
> Sys.getenv('DISPLAY')     # returns localhost:xx.0
localhost:12.0
> x11('localhost:12.0')     # returns error message

现在您并行启动新的 ssh 连接：ssh -Y [e-mail]。您需要在这个新会话中找到 DISPLAY 的值，例如：

在 bash 中：

$ echo $DISPLAY
localhost:13.0

或者在 R 中：

> Sys.getenv('DISPLAY')
localhost:13.0

最后，在原R终端中，将DISPLAY参数设置为新的连接值：

> Sys.setenv('DISPLAY' = 'localhost:13.0')
> x11('localhost:13.0')  # or x11() - both should work

还有一个选择，就是修改ssh配置文件（ForwardX11Timeout）中~/.ssh/config的值。默认情况下，它通常设置为 ~20 分钟（请参阅 man ssh）。您可以尝试将其设置为一天（或更多），例如：ForwardX11Timeout 1d。如果 X11 打开少于 24 小时，这将防止它在任何工作会话期间停止。您甚至可以在此配置文件中设置 ForwardX11Trusted yes。但是，这些选项可能会导致安全漏洞，因此需要谨慎考虑。