使用 ij 和 loci 类使 ImageJ/Fiji Jython 脚本从 bash 脚本工作

到目前为止，我从斐济的脚本编辑器执行了我的 jython 插件。我想在命令行中执行我的 jython 脚本。

在该行执行 jython myscript.py 时

from ij import IJ

我收到错误：

导入错误：没有名为 ij 的模块

我猜是找不到ij的jar文件，通常是ImageJ编辑器找到的。

所以我设置了java类路径：

java -cp “/home/user/input_bash/jars/ij.jar” ij

然后我收到错误：

未找到主类。（费勒：Hauptklasse ij konnte nicht gefunden 奥得盖拉登韦尔登）原因：java.lang.classNotFoundException：ij

我是 Java 新手，这是否意味着我没有使用正确的 jars？

我也是用编辑器来执行的：

from ij import IJ;

print(IJ.getClassLoader().loadClass("ij.IJ")
    .getResource("IJ.class").toString());

哪个给了我目录：/home/user/Software/Fiji.app/jars/ij-1.53c.jar!/ij/IJ.class

这意味着编辑器使用了 ij-1.53c.jar 中的类！然后我尝试： java -cp "/home/lisa/Software/Fiji.app/jars/ij-1.53c.jar\!/ij" ij

由于 \ 增加了 !。

我仍然得到相同的 classNotFoundException。

当我在命令行运行 jython 脚本时，我像这样使用 jython.jar：

java -jar jython.jar somescript.py

如果您在 jython 模块或 jars 中有外部依赖项，您可以将它们添加到类路径中以便它们被拾取。您可能还需要将 jython 模块的路径添加到 sys.path：

import sys
sys.path.append("<path to modules>")

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