问题描述
例如，如果运行一个向 slurm 求和的作业并通过 scancel -u username 取消 slurm 作业并使用 ctrl-c 取消 snakemake，那么在下一次运行时 snakemake 会说：
The files below seem to be incomplete. If you are sure that certain files are not incomplete,mark them as complete with
它怎么知道这个？它是否在内部制作了自己的“触摸文件”？
解决方法
我没有决定性的答案，但也许这会让您找到正确的方向：snakemake 在工作目录中写入一个名为 .snakemake 的隐藏目录（您需要 ls -a 才能看到它） .
在 .snakemake 内有各种子目录，您的问题的答案可能在那里。特别是，有一个带有神秘文件名的 metadata 目录，这些文件名似乎是包含每个作业信息的 json 文件。这些 json 的条目是 "incomplete": true/false。
顺便说一句，很高兴知道 .snakemake/log 包含每个作业的日志。