将 oneHotEncoder 用于 Cox Proportional Hazard

问题描述

我为 Cox 比例风险 (CPH) 模型编写了 Python 代码。我的数据文件 (CSV) 包含分类和非分类变量。为了执行 CPH，我对两个分类变量（study_category 和patient_category）应用了 OneHotEncoder。我在尝试拟合 CPH 模型的行中遇到以下错误。我将三个参数传递给 cph.fit() 方法：dataframe、duration column ()、event column()。我用谷歌搜索了错误，但找不到有用的东西。我是第一次使用 CPH，我们将不胜感激。

Error:
AttributeError: 'ColumnTransformer' object has no attribute 'shape'`

我的python代码：

def meth():
 dataset = pd.read_csv('C:/Users/XYZ/CTR_Project/CPH.csv')
 dataset=dataset.loc[:,['study_Category','patient_Category','Diff_time','Events']]
    
 X=dataset.loc[:,'Events']]

 colm_transf=make_column_transformer((OneHotEncoder(),'patient_Category']),remainder='passthrough')

 colm_transf.fit_transform(X)
 cph= CoxPHFitter()

 cph.fit(colm_transf,duration_col='Diff_time',event_col='Events')
 cph.print_summary()

解决方法

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