问题描述
我正在尝试让 Bowtie2 在 windows10 上工作。我需要运行一个通过路径调用 Bowtie2 的 Python 模块,所以它不能简单地通过 bioconda 运行。这是我到目前为止所做的:
- 下载了 bowtie2-2.3.4-mingw-x86_64(有 Windows 二进制文件的最新版本)
- 更改了我的用户路径以包含 bowtie2-2.3.4-mingw-x86_64 文件的路径
- 尝试运行 Bowtie 教程:使用 setx BT2_HOME "C:\Users\lberd\Documents\Python Scripts\bowtie2-2.3.4-mingw-x86_64",通过检查设置列表确认变量已保存,然后运行代码
BT2_HOME/bowtie2-build
,复制自教程。
执行此操作时,我收到错误消息“'BT2_HOME' 未被识别为内部或外部命令、可运行的程序或批处理文件。”
当我尝试运行使用 Bowtie2 的 python 模块时,我也收到错误“返回非零退出状态 1”。
我正在尝试确定 Bowtie2 是否未成功安装、版本是否太旧,或者我是否不理解命令。谢谢!
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!
如果你已经找到好的解决方法,欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。
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