无法分配 geom_raster 大小矢量的问题

编程问答 2022-04-29

问题描述

我对 size vector cannot be allocated 函数中反复出现的 geom_raster 问题感到惊讶。这个问题发生在小数据集上，在我的例子中是 1559 个观察值。我尝试这样做：

# Read the raster in data frame format
ras_df<-read.csv("https://raw.githubusercontent.com/Leprechault/trash/main/myraster_df.csv")
str(ras_df)
#'data.frame':  1559 obs. of  3 variables:
# $ cc       : num  65 85.6 82.7 85.6 89.4 ...
# $ longitude: num  -50.6 -50.6 -50.6 -50.6 -50.6 ...
# $ latitude : num  -24.2 -24.2 -24.2 -24.2 -24.2 ...

# Representation
ggplot() +
  geom_raster(data = ras_df,aes(x = longitude,y = latitude,fill = cc)) + 
  scale_fill_gradientn(name="Canopy cover",colours = rev(terrain.colors(100)))+
  xlab("longitude") + ylab("latitude") +
  theme_bw() + 
  coord_quickmap() +
  theme(panel.border = element_blank(),panel.grid.major = element_blank(),panel.grid.minor = element_blank(),axis.line = element_line(colour = "black"),text=element_text(size=16,family="serif"),legend.position="bottom")
#
#
#Error: 20254.0 Gb size vector cannot be allocated

但如果我使用普通的 plot() 函数，这不会发生，但我会寻找更漂亮的表示，如 ggplot2 输出。一些包含一些解决方案的帖子对我来说效果不佳（例如，SpatialPixelsDataFrame 转换和容差控制）。

请问，我有什么想法可以修复它吗？

解决方法

错误附带的警告是信息性的

另外：警告信息：
1：光栅像素以不均匀的水平间隔放置并且会发生偏移。考虑使用 geom_tile() 代替。
2：光栅像素的垂直间隔不均匀，会发生偏移。考虑改用 geom_tile()。

当数据具有虚假精度时会发生这种情况，因此 geom_raster 尝试制作一个使用大量内存的非常精细的网格。

解决方案只是将数据四舍五入到适当的精度。

library(tidyverse)
ras_df <- ras_df %>% mutate(across(c(latitude,longitude),round,digits = 4))

情节然后工作正常。

ggplot2rrr-rasterrastersf