问题描述
我最近通过预编译的二进制文件下载了 Bowtie2-2.3.4,并将文件位置添加到我的路径中。我还安装了草莓 perl,并将该位置也添加到了我的路径中。
当我尝试通过键入 bowtie2
、bowtie2 -- version
、bowtie1 - inspect
来确定是否正确安装了 bowtie2 时,收到消息:“无法打开 perl 脚本”C:\Users\lberd\Documents \Python”:没有这样的文件或目录”。如果我在我的文档文件夹中创建一个名为 Python 的空目录,它会给我“无法打开 perl 脚本“C:\Users\lberd\Documents\Python”:权限被拒绝”。
我安装了 python 3.9.5,该位置也在我的路径中。
bowtie2 在 python 文件夹中寻找什么?
解决方法
发现问题:bowtie 二进制文件保存在名为“python scripts”的文件夹中 bowtie 不知道如何处理文件夹名称中的空格,这就是为什么它停在“python”处。