RColorBrewer::brewer.pal(n, pal) 中的错误：NA 不是 brewer.pal 的有效调色板名称

问题描述

我正在尝试在 pheatmap 中注释数据点。在绘制热图之前，一切正常。

data <- as.matrix(Round_1)                                                            
library(pheatmap)                                                                       
df = data.frame(Annotation)                                                               
colnames(df) = colnames(data)                                                             
pheatmap(data,cluster_rows = FALSE,cellwidth = 10,cellheight = 12,annotation_col = df)`

最后一行出现错误：Error in RColorBrewer::brewer.pal(n,pal) : NA is not a valid palette name for brewer.pal

我什至不使用 RColorBrewer 包，也不指定任何颜色。如果我确实使用了 RColorBrewer 库并指定了注释颜色，则会出现以下错误：

    Error in annotation_colors[[names(annotation)[i]]] <- brewer_pal("seq",: 
  more elements supplied than there are to replace

至于独立列注解，我有3个簇；每个数据点都应该属于一个。

解决方法

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pheatmap r r