无法使用 biopython 从 pubmed 检索文件

问题描述

我正在使用此脚本从 pubmed 获取有关 covid-19 的数据

from Bio import Entrez
    def search(query):
        Entrez.email = 'your.email@example.com'
        handle = Entrez.esearch(db='pubmed',sort='relevance',retmax='20',retmode='xml',term=query)
        results = Entrez.read(handle)
        return results
    
    def fetch_details(id_list):
        ids = ','.join(id_list)
        Entrez.email = 'your.email@example.com'
        handle = Entrez.efetch(db='pubmed',id=ids)
        results = Entrez.read(handle)
        return results
    
    if __name__ == '__main__':
        results = search('covid-19')
        id_list = results['IdList']
        papers = fetch_details(id_list)
        for i,paper in enumerate(papers['PubmedArticle']):
            print("{}) {}".format(i+1,paper['MedlineCitation']['Article']['ArticleTitle']))

我在控制台中得到结果，但我想要的是自动下载诸如 XML 文件或文章文本文件之类的文件，请提供有关如何执行此操作的任何建议，我用谷歌搜索但没有找到

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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