如何从 Reduction Wrappers 在 R 中执行 PaCMAP 降维？

编程问答 2022-04-27

问题描述

我正在尝试在 R 中实现 PaCMAP 降维，如本文档 https://rdrr.io/github/milescsmith/dim.reduction.wrappers/man/pacmap.html 所示，pacmap 函数是 https://github.com/YingfanWang/PaCMAP 中原始 python pacmap 的包装函数。>

下面是一些如何在 Python 中完成的示例

import pandas as pd
import pacmap
fraud_data = pd.read_csv(r'C:/Users/User/Desktop/Open Source Dataset/fraud_data.csv')
embedding = pacmap.PaCMAP(n_dims=2,n_neighbors=None,MN_ratio=0.5,FP_ratio=2.0) 
X_transformed = embedding.fit_transform(fraud_data.values,init="pca")

这是我在 R 版本 4.1.0 中尝试但无济于事的方法：

library(ReductionWrappers)
fraud_data <- read.csv("fraud_data")
pacmap_mapping <- pacmap(as.matrix(fraud_data),n_dims=2,n_neighbors=2,MN_ratio=1,FP_ratio=2) 

Error in py_call_impl(callable,dots$args,dots$keywords) : 
  TypeError: 'float' object cannot be interpreted as an integer 

pacmap_mapping <- pacmap(fraud_data,FP_ratio=2) 

 Error in py_call_impl(callable,dots$keywords) : 
  TypeError: '(0,slice(None,None,None))' is an invalid key

我不明白如何解决此错误，因为已经完成了最少的示例，我需要什么输入才能使其工作？

以下是用于执行此示例的数据：https://drive.google.com/file/d/1Yt4V1Ir00fm1vQ9futziWbwjUE9VvYK7/view?usp=sharing

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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dimensionality-reductionpythonrr