皮尔逊相关性

问题描述

| 我有一个数据框，如下所示：

x <- data.frame(Name=c(\"a\",\"b\",\"c\",\"d\",\"e\"),A=(1:5),B=(2:6),C=(7:11),D=c(1,1,1))

我想得到一个数据框，其中包括a vs b，a vs c，a vs d，a vs e，b vs a，b vs c，b vs d，b vs e ....的所有皮尔逊系数...（不包括自我比较，例如aa，bb等）。 换句话说，我想更改以下数据框

            A   B   C   D
a   1   2   7   1
b   2   3   8   1
c   3   4   9   1
d   4   5   10  1
e   5   6   11  1

到这样的结果数据框

a   b   0.989143436
a   c   0.963282002
a   d   0.93048421
a   e   0.89585579
b   c   0.9922798
b   d   0.974216034
b   e   0.951427811
c   d   0.994675789
c   e   0.982264673
d   e   0.996357429

请为您提供有效的方法。 编辑 感谢Michaelv2的帮助。 根据建议的代码，我发现结果如下：

   X1 X2 value  
1   A  A     1   
2   B  A     1   
3   C  A     1  
4   D  A    NA  
5   A  B     1  
6   B  B     1  
7   C  B     1  
8   D  B    NA  
9   A  C     1  
10  B  C     1  
11  C  C     1  
12  D  C    NA  
13  A  D    NA  
14  B  D    NA  
15  C  D    NA  
16  D  D     1  

错误消息是“ 警告信息： 在cor（x [2：5]中，方法= \“ pearson \”）：标准偏差为零\“ 在我看来，我可能滥用了代码，请您进一步指导如何进一步解决此问题？谢谢。     

解决方法

        您可以使用如下所示的内容：

require(reshape)

y <- as.data.frame(t(x[2:5]),stringsAsFactors=FALSE)
colnames(y) <- x[[1]]

yrho <- melt(cor(y,method=\"pearson\"))
subset(yrho,yrho$X1 != yrho$X2)

结果：

    X1 X2     value
2   b  a 0.9891434
3   c  a 0.9632820
4   d  a 0.9304842
5   e  a 0.8958558
6   a  b 0.9891434
8   c  b 0.9922798
9   d  b 0.9742160
10  e  b 0.9514278
11  a  c 0.9632820
12  b  c 0.9922798
14  d  c 0.9946758
15  e  c 0.9822647
16  a  d 0.9304842
17  b  d 0.9742160
18  c  d 0.9946758
20  e  d 0.9963574
21  a  e 0.8958558
22  b  e 0.9514278
23  c  e 0.9822647
24  d  e 0.9963574