问题描述
我正在了解 Seurat 在 scRNA-seq 数据集中的标记基因和聚类。但是,我对阳性标记和阴性标记这两个术语感到困惑。我所理解的是簇的标记基因是在该簇的细胞中高度表达(高计数)的基因。假设集群 A 有 200 个基因。我的问题是:
- 我能说那 200 个基因是簇 A 的标记基因吗?
- 如何确定哪些标记基因是阳性标记基因,哪些是阴性标记基因?
解决方法
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