如何从 Java 执行命令 R CMD Rserve

问题描述

我正在尝试使用 Runtime exec 函数从我的 java 后端启动 Rserve。我通常可以执行像 killall 这样的 linux 命令来停止该进程,但我无法启动它。 您可以使用此命令从命令行启动 Rserve

R CMD Rserve

并且工作正常。但是来自java:

Process pr = Runtime.getRuntime().exec("R CMD Rserve")

它不起作用。那么我如何从 java 使用这个命令?

解决方法

exec 与“当我在 shell 中键入它时它起作用”不同。毕竟,当您在“命令行”上键入它时,“命令行”本身就是一个应用程序。通常是 /bin/bash,但有很多很多壳。

shell 不只是接收您输入的内容,然后将其逐字逐字地扔到操作系统上然后“在这里”。运行这个'。它需要您输入的内容并对其进行按摩。对其应用转换。 然后,经过按摩的东西被扔到操作系统上,并带有“here,run this”。

Java 与此类似,因为它接受您编写的内容,对其进行处理,然后将其扔给操作系统。

这些按摩完全不同

例如,/bin/bash 会将 *.txt 变成运行 ls *.txt 的结果。 Java 不会这样做,因此如果您尝试运行,例如exec("/bin/ls *.txt") 在 Java 中,它不起作用。 ls 尝试查找字面上称为 *.txt 的文件,并报告找不到它。

诀窍是要了解 bash 对您的输入所做的许多事情,并且不要依赖这些。 java实际上为按摩所做的事情取决于操作系统,所以也不要依赖它。因此,一些规则:

  1. 始终使用绝对路径。不要运行R CMD Rserve。例如,运行 /usr/local/share/R/bin/R CMD RServe。我不知道 R 在哪里,但它是您系统上某处的可执行文件。找到绝对路径; bash 所做的按摩之一是应用 $PATH。 Java 可能会或可能不会应用路径,谁知道您的路径设置是什么,以及 java 进程是否与您的 bash 具有相同的 PATH 设置;它可能不会,因此,绝对不要依赖它,并且始终,始终,编写绝对路径。

  2. 注意 bash 内部结构,切勿使用它们。 lsps 通常是内部结构;根据定义,java 不能运行它们。如果您必须依赖 bashisms,则必须实际运行 bash。不是exec("ls"),而是exec("/bin/bash","-c","ls")

  3. 永远不要依赖java的空格分割能力。永远不要使用exec(cmd),也永远不要使用Runtime.getRuntime().exec。考虑这些被禁止的方法。创建一个 ProcessBuilder,并且始终是 List<String> 变体(其中列表中的第一个条目是命令的绝对路径,其余的是命令行参数。 >

这让您:

// to stop

List<String> args = List.of("/bin/bash","killall -9 RServe");
ProcessBuilder pb = new ProcessBuilder(args);
// if you need to read what bash produces,config that here.
pb.start();

// to start
List<String> args = List.of("/abs/path/to/R","CMD","RServe");
ProcessBuilder pb = new ProcessBuilder(args);
// if you need to read what bash produces,config that here.
pb.start();

当然,除非您的java进程是启动它的进程,否则您将无法kill -9,因此很可能无法从java执行此操作-您只是没有权限。

,

我知道它改变了我试图调用这个过程的方式。 rzwitserloot 的回答对于解决这个问题非常有用。 我不知道“R CMD”命令的内部结构,但它不喜欢 java 进程构建器。 还有其他方法可以在 R 控制台中调用 Rserver 守护程序,所以我尝试这样做。这工作正常:

List<String> args = List.of("/bin/sh","echo 'library(Rserve);Rserve(args=\"--no-save --slave\");'| /usr/lib/R/bin/R --no-save --slave");
        ProcessBuilder pb = new ProcessBuilder(args);
        Process p = pb.start();
,

我查看了一些文档并找到了一些东西。试试这个:

try {
    String command ="R CMD Rserve";
    BufferedWriter out = new BufferedWriter(new FileWriter(new File("path/to/file"),true));
    final Process process = Runtime.getRuntime().exec(command);
    BufferedReader buf = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream()));
    String line;
    while ((line = buf.readLine()) != null) {
        out.write(line);
        out.newLine();
    }
    buf.close();
    out.close();
    int returnCode = process.waitFor();
    System.out.println("Return code = " + returnCode);
    } catch (Exception e) {
        e.printStackTrace();
    }

让我知道这是否有帮助:)

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