问题描述
在实验设计中,我尝试设计一个 Graeco Latin-Square
,我相信它是 Latin Square
设计的扩展版本,具有更多因素......但是,我发现它的行为很奇怪,这里是使用的一些片段处理1和2模拟长度为1-26
graeco_design_possibility <- function(test_until=20){
library(agricolae)
k_graeco <- seq(2,test_until,1)
bool_possibility <- c()
for(n in 2:test_until){
b <- design.graeco(LETTERS[1:n],1:n)
if(is.null(b)){
bool_possibility <- c(bool_possibility,FALSE)
}else{
bool_possibility <- c(bool_possibility,TRUE)
}
}
simulation_graeco <- data.frame(number_k = k_graeco,success_run=bool_possibility)
return(simulation_graeco)
}
当我对此进行测试时,模拟结果如下:(注意:k=26 之后会发生更多奇怪的错误)
g <- graeco_design_possibility(26)
g
number_k success_run
1 2 TRUE
2 3 TRUE
3 4 TRUE
4 5 TRUE
5 6 FALSE
6 7 TRUE
7 8 TRUE
8 9 TRUE
9 10 TRUE
10 11 TRUE
11 12 TRUE
12 13 TRUE
13 14 FALSE
14 15 TRUE
15 16 FALSE
16 17 TRUE
17 18 FALSE
18 19 TRUE
19 20 FALSE
20 21 TRUE
21 22 FALSE
22 23 TRUE
23 24 FALSE
24 25 TRUE
25 26 FALSE
就是这样,我查看了文档,它说该函数仅适用于奇数和偶数(4、8、10 和 12)的平方我没有对解释了解很多,因为模拟的结果与解释有点矛盾:6,14,16 是偶数对吗?那么为什么问题会一直这样呢?
解决方法
我删除了开发人员应该在 design.graeco()
函数中限制的限制,老实说我不知道为什么要限制处理的特定长度,这是 Graeco Latin Square 设计没有限制的最终结果
design_graeco_custom <- function(trt1,trt2,serie = 2,seed = 0,kinds = "Super-Duper",randomization = TRUE){
number <- 10
if (serie > 0)
number <- 10^serie
r <- length(trt1)
if (seed == 0) {
genera <- runif(1)
seed <- .Random.seed[3]
}
set.seed(seed,kinds)
parameters <- list(design = "graeco",trt1 = trt1,trt2 = trt2,r = r,serie = serie,seed = seed,kinds = kinds,randomization)
col <- rep(gl(r,1),r)
fila <- gl(r,r)
fila <- as.character(fila)
fila <- as.numeric(fila)
plots <- fila * number + (1:r)
C1 <- data.frame(plots,row = factor(fila),col)
C2 <- C1
a <- 1:(r * r)
dim(a) <- c(r,r)
for (i in 1:r) {
for (j in 1:r) {
k <- i + j - 1
if (k > r)
k <- i + j - r - 1
a[i,j] <- k
}
}
m <- trt1
if (randomization)
m <- sample(trt1,r)
C1 <- data.frame(C1,m[a])
m <- trt2
if (randomization)
m <- sample(trt2,r)
C2 <- data.frame(C2,m[a])
ntr <- length(trt1)
C1 <- data.frame(C1,B = 0)
for (k in 1:r) {
x <- C1[k,4]
i <- 1
for (j in 1:(r^2)) {
y <- C2[(k - 1) * r + i,4]
if (C1[j,4] == x) {
C1[j,5] <- y
i <- i + 1
}
}
}
C1[,4] <- as.factor(C1[,4])
C1[,5] <- as.factor(C1[,5])
names(C1)[4] <- c(paste(deparse(substitute(trt1))))
names(C1)[5] <- c(paste(deparse(substitute(trt2))))
outdesign <- list(parameters = parameters,sketch = matrix(paste(C1[,4],C1[,5]),byrow = TRUE,ncol = r),book = C1)
return(outdesign)
}
而且我发现处理超过 26 时,我决定使用额外的辅助函数来生成可能的字母:
letters_construction <- function(n=27,format_letter="upper"){
if(n > 26 && n <= 702){
letter_result <- NULL
letter_comb <- NULL
if(format_letter=="upper"){
letter_result <- LETTERS[1:26]
letter_comb <- expand.grid(LETTERS[1:26],LETTERS[1:26])
}else if(format_letter=="lower"){
letter_result <- letters[1:26]
letter_comb <- expand.grid(letters[1:26],letters[1:26])
}
letter_comb$comb <- paste0(letter_comb$Var2,letter_comb$Var1)
letter_finalcomb <- as.character(letter_comb$comb)
n_remainder <- n-26
letter_result <- c(letter_result,letter_finalcomb[1:n_remainder])
return(letter_result)
}
}
所以我可以像这样实现大希腊拉丁广场设计:
b <- letters_construction(30)
design_graeco_custom(b,1:30)