问题描述
我正在尝试使用 Java 从内存中获取执行 BLAST（基本局部对齐搜索工具）查询的结果。我目前正在从 Java 程序中调用 BLAST 查询，一旦 BLAST 生成输出文件（作为文本），我就通过将其复制到数组中来处理文本文件的内容。我不想在此处将输出作为文件获取，而是将其捕获在内存中（就在将其写入文件之前）并立即将其存储在数组中以供进一步处理。默认的 BLAST 查询可能如下所示： blastn –db nt –query nt.fsa –out results.txt 其中 results.txt 是将 BLAST 查询的输出定向到的输出文件，nt是被查询的数据库，nt.fsa 是被查询的输入。任何帮助将不胜感激。
解决方法
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