如何创建 Beta 多样性距离箱线图

问题描述

我正在尝试根据 phyloseq 对象的两个条件之间的 Beta 多样性箱线图生成箱线图。

我有一个由 vegdist 函数生成的 Morisita-horn 距离：

vegdist<-vegdist(t(otu_table(physeq_genus_3a)),method="horn")#matrice distance Morisita-horn
vegdist<-as.matrix(vegdist)

现在我有一个矩阵，我想在两个条件下创建一个 Morisita-horn 指数的平均距离箱线图，如下图所示。

enter image description here

我想用 ggplot 做一个简单的箱线图，但因为它是一个矩阵而不是一个数据框，我做不到。

欢迎提供任何帮助或建议。

解决方法

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