在 r 中使用 igraph 包可视化图形

问题描述

我有如下相关系数矩阵，并尝试使用 __mul__ 包及其 igraph 将其可视化。没有一个布局输出清晰的网络。谁能建议我如何解决这个问题？

layouts

解决方法

你可以试试下面的代码

g <- graph_from_adjacency_matrix(adjm,weighted = "wt",mode = "undirected",diag = F)
plot(g,edge.label = round(E(g)$wt,2))

其中作为边缘属性的权重在 wt 中被命名为 graph_from_adjacency_matrix。然后，当您绘制 g 时，您可以指定要将 wt 打印为 edge.label = round(E(g)$wt,2) 的边缘标签。

,

Layout.lgl 似乎可以很好地处理您的数据：

library(igraph)
g <- graph_from_adjacency_matrix(adjm,weighted=T,mode="undirected",diag=F)

plot(g,layout=layout.lgl,edge.arrow.size=0.6,vertex.label.cex=1,vertex.label.font=2,vertex.shape="circle",vertex.size=5,vertex.label.color="black")