在 PyMol 中的残基之间创建实线

问题描述

def interactingResidues(process_label,pdb_file,dataframe,file_name):
import __main__
__main__.pymol_argv = ['pymol','-qc']  # -q launches in quiet mode,-c launches in GUI-less mode
import pymol2
p1 = pymol2.PyMOL()  # initiating pymol2 instance as a variable allows for a cleaner exit between sessions.
p1.start()

pdb_file = pdb_file.strip('.pdb')

p1.cmd.fetch(pdb_file)
p1.cmd.remove('solvent')
p1.cmd.color('0xc2c2c2')
p1.cmd.bg_color(color='white')
p1.cmd.set('fog','off')

for index,row in dataframe.iterrows():
    p1.cmd.distance('(////{0}/CA)'.format(row['Mut1 Position']),'(////{0}/CA)'.format(row['Mut2 Position']))
    p1.cmd.color('black',selection=('dist' + str(index + 1).zfill(2)))
p1.cmd.hide('labels')

p1.cmd.set('ray_opaque_background','0')
p1.cmd.png(("./" + process_label + "PDB_distances/" + file_name + ".png"),ray=0)
p1.stop()
return

这段代码是我目前用来从我正在制作的 python 脚本生成上图的代码。我需要在相互作用残基的 C-alpha 之间画线，到目前为止，我发现最好的方法是使用距离线并隐藏测量值。

我已经设法让这些线条改变颜色，但我真的很想将它们更改为实线！ 有没有办法改变距离线的线型？如果没有，有没有另一种方法可以画线而不用虚线？

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

如果你已经找到好的解决方法，欢迎将解决方案带上本链接一起发送给小编。

小编邮箱:dio#foxmail.com (将#修改为@）

pymol python