问题描述
我在受控访问下从 dbGAP 下载了一组“.sra”文件（来自 sra-toolkit 的 prefetch 命令）。我想知道是否可以在不创建与 dbGAP 的连接的情况下将它们转换为 fastq 文件（使用 sra-toolkit）。我曾尝试使用 fasterq-dump 执行此操作，但它告诉我需要获得权限才能执行此操作。我也尝试使用 --ngc 选项，但在（或多或少）十小时后，它返回以下错误：
kernel:watchdog: BUG: soft lockup - cpu#23 卡住了 22 秒！ [kworker/u64:3:80990]2021-07-12T19:14:19 fastq-dump.2.11.0 错误：在文件系统模块中销毁文件时未知 - 未知系统错误'输入/输出错误（5）'>
显然很难在网络上找到有关此主题的内容。 有人有任何线索吗？我将不胜感激，因为我从三月份就开始尝试这样做！
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！
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