如何使用 fastai 打开 dicom 图像？

问题描述

我正在使用 pydicom 处理 Dicom 图像。 但是我的项目在 fasai 中，我想使用 fastai 库打开那个 Dicom 图像。 在 fastai 中，我们通常对 png 或 jpg 执行 open_image(path) 它的工作正常，但是如果我们有 Dicom 图像，我们无法轻松打开它。所以我使用 pydicom，他们得到他们的像素数组，然后转换为 RGB and resized. But when I again apply to open that NumPy array which I made it can't open it because open_image needs path` 而不是一个 numpy 图像。 我有一个问题，如何像打开简单的 png 图像一样打开 Dicom 图像。

我们像在 fastai 中一样打开普通图像：

im = open_image(img_path)
img.show(figsize=(4,4),ax=axs[0])

它给了我们 (3,H,W)

的形状

但在 Dicom 的图像中，打开它并不容易。我需要像以前一样打开它。我尝试了下面的代码来使用 pydicom 库获取图像。

    if (extension == 'dicom'):
    xray = read_xray(img_path)
    img = resize(xray)
    img = to_rgb(img)
    img = normalize(img)
    img = torch.from_numpy(img)
    img = np.transpose(img,[2,1])

请帮助摆脱这个问题。

解决方法

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