来自 .Rnw 文件的 knitr 章节参考书目？

问题描述

可以使用 BiblateX 和直接的 .tex 文件创建章节参考书目，如本 MWE 所示：

% main.tex
\documentclass{report}
\usepackage{natbib}
\usepackage{chapterbib}

\begin{document}

\include{chap1}
\include{chap2}

\end{document}


% chap1.tex
\chapter{one chapter}

text~\cite{paper1}
text~\cite{paper2}

\bibliographystyle{plainnat}
\bibliography{biblio}


% chap2.tex
\chapter{another chapter}

text~\cite{paper2,paper3}

\bibliographystyle{plainnat}
\bibliography{biblio}


% biblio.bib
@Article{paper1,author =       {John Smith},title =        {A title},journal =      {A Journal},year =         {2010}
}
@Article{paper2,author =       {John Doe},title =        {A paper},journal =      {Another journal},year =         {2009}
}
@Article{paper3,author =       {Yuppie Networking},title =        {My paper},journal =      {The best journal},year =         {2000}
}

使用以下脚本可以成功编译以上文件：

% compile.bash
#!/bin/bash
pdflatex main.tex
for auxfile in chaP*.aux
do
    bibtex `basename $auxfile .aux`
done
pdflatex main.tex
pdflatex main.tex

我希望使用 knitr、BiblateX 和 .Rnw 文件（不是 .tex 文件）重新创建上述功能。这是一个小的非工作示例。 （我知道这个例子缺少 R 代码块，但我的用例会有 R 代码块。）

% main.Rnw
\documentclass{report}
\usepackage{natbib}
\usepackage{chapterbib}

\begin{document}

\Sexpr{knitr::knit_child("chap1.Rnw")}
\Sexpr{knitr::knit_child("chap2.Rnw")}

\end{document}


% chap1.Rnw
\chapter{one chapter}

text~\cite{paper1}
text~\cite{paper2}

\bibliographystyle{plainnat}
\bibliography{biblio}


% chap2.Rnw
\chapter{another chapter}

text~\cite{paper2,paper3}

\bibliographystyle{plainnat}
\bibliography{biblio}


% knit_script.R
knitr::knit(input = "main.Rnw")


% compileRnw.bash
/usr/local/bin/Rscript knit_script.R

pdflatex main.tex
for auxfile in chaP*.aux
do
    bibtex `basename $auxfile .aux`
done
pdflatex main.tex
pdflatex main.tex

当我运行 compileRnw.bash 脚本时，生成的文档缺少参考书目。

从 .Rnw 文件创建包含章节参考书目的文档时，main.Rnw 和 compileRnw.bash 应该是什么样的？

在此先感谢您的帮助！

解决方法

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