错误：samtools 排序：无法从 SAR-COV-2 的“-”ARTIC 管道读取标头

问题描述

我在运行 artic minion 命令时遇到问题 吃

1. 它无法识别我提供的路径的 pimer 方案。所以它创建了新的引物集文件夹。

2. 运行时报错

samtools 排序：无法从“-”读取标题

命令是：

artic minion --minimap2 --medaka --medaka-model r941_min_fast_g303 --normalise 200 --threads 6 --scheme-directory /home/fmr/fieldbioinformatics-1.2.1/primer_scheme/ --read-file barcode3.fastq nCoV-2019/V3 barcode3

请告诉我解决方案。

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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