skimage.external.TiffWriter：命名重要性

问题描述

我需要将图像保存为 .tif。我无法安装新的 python 包（大学控制的计算机，使用 Anaconda），所以我决定使用 skimage.external 中的可用 Tifffile。

麻烦来了：以下代码运行良好并保存了我的图像的 3 个通道：

from skimage.external.tifffile import TiffWriter
import numpy as np
path = '26.01.2021 NLFK CPV timeseries A3B10 imaged 07.04.2021/26.01.2021 NLFK CPV timeseries A3B10 imaged 07.04.2021/Processed'
result_img2 = np.zeros((3,512,512))
res = (6.006634765625e-08,6.006634765625e-08)
raw_b = str('abcdefg')
Meta = {}
for i,c in enumerate(result_img2): 
    with TiffWriter(path+'/'+'test_C'+str(i)+'.tif') as tif:
        tif.save(np.array(c,dtype='uint8'),resolution=res,description=raw_b,Metadata=Meta)

但我不能将我的图像命名为“测试”！但是，这样做：

filename = "07.04.2021 NLFK nucleolin r488 A3B10 m546 DAPI mock Preview 2_nucleus1_"
with TiffWriter(path+'/'+filename+str(i)+'.tif') as tif:
    tif.save(np.array(c,Metadata=Meta)

导致 Errno 2 错误。

我尝试检查此文件名是否包含禁止字符（来自另一篇文章）：

keepcharacters = (' ','.','_')
filename = "".join(c for c in filename if c.isalnum() or c in keepcharacters).rstrip()

或编码 filename.encode('utf8') 并且它也失败了（再次，Errno 2）。

名称表示每次实验的情况，每次都会改变，所以我需要这样保存。快速检查后，我可以将其保存在 .py 的根目录下。但同样，我需要将文件保存在各自的文件夹中。知道我的麻烦在哪里吗？

解决方法

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python scikit-image tiff