问题描述
您好,我有一些 fastq 文件需要合并到一个目录中(一个是正向序列,一个是反向序列) 到目前为止,我已经编写了这个脚本,但它所做的只是为每个文件创建一个目录,而不是将它们组合在一起。
#!/bin/bash
#Create directory using filenames and move the files to its respective folder
for folder in name;
do
echo $folder
cd $folder
ls
for file in 3*_S*R*.fastq.gz;
do mkdir -- "${file%.fastq.gz}";
mv -- "$file" "${file%.fastq.gz}";
done
cd ../
done
文件命名如下:
100000_S00_R1_001(转发) 100000_S00_R2_001(反向)
100001_S01_R1_001(向前) 100001_S01_R2_001(反向)
100002_S02_R1_001(向前) 100002_S02_R2_001(反向)
等
所以每次我想将 R1 和 R2 合并到一个目录中
先谢谢你
解决方法
暂无找到可以解决该程序问题的有效方法,小编努力寻找整理中!
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