在 glmmTMB 中拟合负二项式模型和协方差结构语法

编程问答 2022-08-26

问题描述

我阅读了 glmmTMB 包小插曲 (https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/vignettes/covstruct.html) 并有以下问题：

  1. 在小插图中，他们使用
    2. 来拟合模型 
glmmTMB(y~ar1(times+0|group),data=dat0)

并提到 time+0 对应于将观察向量 y（行）与随机效应向量 u（列）连接起来的设计矩阵 Z"

+0 是什么意思？ (times|group)、(times+1|group) 和 (1|group) 有什么区别？

是否有关于协方差结构语法的综合总结？

  1. 如果我想在 R 函数生成结果 y_{ij} 时拟合负二项式模型：rnbinom(mu=x_{ij}beta+b_i+e_{ij},size=1)，其中 i 是组索引，j 是单个索引，b_i～N(0,1),e_{ij}~N(0,1)。以下代码是否正确指定为模型？
dat <- data.frame(y,x,group)
glmmTMB(y~x+(1|group),data=dat,family=nbinom2)

感谢任何建议和帮助。预先感谢您的帮助！

解决方法

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