如何通过匹配 R 中的特定列将数百列合并到一个数据框中？

编程问答 2022-07-14

问题描述

我目前有数百个包含唯一 ID 和非标准化读取计数的文件。我想从每个文件中获取读取计数，并将它们全部与第一列中的唯一 ID 匹配。但是，每个文件都有不同数量的计数和不同的 ID，这些 ID 可能包含也可能不包含来自最后一个文件的重复项。 （基本上我想为 DESeq2 制作一个计数文件）

我使用下面的代码来合并这些文件，但计数与原始 ID 不匹配。

我的总体目标是从每个文件中获取未规范化的读取计数，并将它们与一个数据框与相应的唯一 ID 的总列表相匹配——如果该文件没有该特定 ID 的计数，则可以填充0.

'''

DF = do.call(cbindX,lapply( list.files(pattern=".*.txt"),FUN=function(x) { 
                       aColumn = read.delim(x,header=T)[,c("MINTbase.Unique.ID","Unnormalized.read.counts")];
                       colnames(aColumn)[2] = x;
                       aColumn;
                     }
             )
)
DF = DF[,!duplicated(colnames(DF))]

'''

解决方法

暂无找到可以解决该程序问题的有效方法，小编努力寻找整理中！

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cbindmergemergerrrbind