如何将 .csv 文件数据导入 gsl

问题描述

X,Y,Z
0,0
0,0
-0.00624347,-0.0182673,1.00063
-0.00845628,-0.0374925,1.00058
-0.00494793,-0.0295639,0.927447
-0.00285682,-0.0926582,0.885783
-0.00832563,-0.02957,0.697834

我想把它放入分别对应于X列、Y列和Z列的三个gsl_vectors（来自GSL:https://www.gnu.org/software/gsl/doc/html/vectors.html）。我之所以要这样做，是因为我以后想对这些数据使用 GNU 科学库中实现的函数。我想强调的是，这些函数只能在 gsl_vectors 上工作，而不能在 std:vectors 上工作。

我的方法：

将 .csv 中的数据放入 std:vectors，然后将这些向量转换为 gsl_vectors。那没有用。
将 .csv 文件中的数据直接放入 gsl_vectors：

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <istream>
#include <string>
#include <sstream>
#include<algorithm>
#include <gsl/gsl_linalg.h>
#include <gsl/gsl_vector.h>

struct acceleration {
    gsl_vector AccX;
    gsl_vector AccY;
    gsl_vector AccZ;
};

//function prototypes
acceleration read_csv(acceleration& A);
//end function prototypes

int main(void)
{
    // ==================READ THE CSV=========================
    acceleration data;
    data = read_csv(data);
    printf("/n");
    gsl_vector_fprintf(stdout,&data.AccX,"%lf");
    
    return 0;

}

acceleration read_csv(acceleration& SA)
{
    std::string buffer;/* Declare a buffer for the data that will be read*/
    std::string bacx,bacy,bacz;
    std::ifstream inputfile;
    inputfile.open("buffer.csv"); /* open file for reading*/
    if (!inputfile.is_open())
        {
            std::cout << "Error opening file" << std::endl;
        }
    std::stringstream aux(buffer);
    getline(aux,bacx,',');
    getline(aux,bacz,');
    size_t i{ 0 };
    while (getline(inputfile,buffer))
    {
        std::stringstream aux(buffer);
    
        getline(aux,');
        if (bacx.compare("AX") != 0)
            gsl_vector_set(&SA.AccX,i,stod(bacx));

        getline(aux,');
        if (bacy.compare("AY") != 0)
            gsl_vector_set(&SA.AccY,stod(bacy));

        getline(aux,');
        if (bacz.compare("AZ") != 0)
            gsl_vector_set(&SA.AccZ,stod(bacz));
        i++;
    }  
    inputfile.close();
    return (SA);

}

这在控制台上没有输出，如果我调试它，函数 gsl_vector_set 会抛出异常：

在 progr.exe 中的 0x7A5EED1A (gsld.dll) 处抛出异常：0xC0000005：访问冲突写入位置 0x3333332

在gsl_set_vector的行：v->data[i * v->stride] = x;

将 .csv 数据放入 gsl_block 中，然后将其切片为 gsl_vectors。在这里，我在尝试将数据放入块时遇到异常。然后，为了将块切成向量，我假设我必须使用 gsl_vector_alloc_from_block() 函数，但我没有找到任何关于如何使用这个函数的例子。我确实需要了解其他人通常如何使用函数，因为我是 C++ 新手。到目前为止，我对这个想法的看法如下：

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <gsl/gsl_linalg.h>
#include <gsl/gsl_vector.h>

//function prototypes
gsl_block read_csv(void);
//end function prototypes

int main(void)
{
    // ==================READ THE CSV INTO A BLOCK=========================
    gsl_block data;
    data = read_csv();
    // =================Now SLICE THE BLOCK: HOW?==========================
    // use gsl_vector_alloc_from_block() but how?
    return 0;
}

//function declarations
gsl_block read_csv(void)
{
    FILE* inputfile;
    fopen_s(&inputfile,"buffer.csv","r"); /* open file for reading*/
    if (inputfile == NULL) 
        std::cout << "file does not exist \n";
    fseek(inputfile,0L,SEEK_END); //go until the end
    int file_size = ftell(inputfile); //in order to tell the size of the file
    gsl_block* b = gsl_block_alloc(file_size);
    if(inputfile)
        gsl_block_fscanf(inputfile,b);
    
    fclose(inputfile);

    return *b;
    
}
//end function declarations

如果我运行这个，我得到：

调试错误！ abort() 已被调用

在控制台上显示：

gsl: C:\DEV\vcpkg\buildtrees\gsl\src\gsl-2-fb511965d5.clean\block\fprintf_source.c:90: 错误: fscanf 失败调用了默认的 GSL 错误处理程序。

如果我调试它，gsl_error 函数会抛出异常：

progr.exe 触发了断点。

在abort ();

总而言之，我真正想要的是将 .csv 读入 gsl_vectors。如果我的方法不行，那是可以理解的。但我希望有更多有经验的程序员可以帮助我摆脱困境。谢谢！

解决方法

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如何将 .csv 文件数据导入 gsl_vectors？ C++

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