我有一个看起来像这样的fasta文件：
>0011 my.header CAAGTTTATCCACATAATGCGAATAACCAATAATCCTTTTCATAAGTCTATTCTTCATAATCTAAATCGT TTTCAAGTACATAATTATCCTTTGCCTGTTCGTTAGTTTTATTAAAATTATACTGATCTTTCTTTTTCAT CCCACGGGTTAAAATCTTCCTCAATCGGTGGGTTTTCTTCATGAAATTGTTTCATTTATTTGCTGTTTTT AGTTCTCCGATTGTATAACACTTAGTTGTATTAGTGCCGGGTAGTCTATAATTAGCCTCTTTTATATACC CACGCTTTAATAATCTGTTTACAGAATTATATAATTTGCTCTTAGACATAAAAGGAATAATTTCTCTAAG TTTAGAAATCGTAATAAAAACGGTATTAGGTTCTTTCTTTACCCTACATCCCTTAAACTTATCCTTATAT GTATCAGTACAAAGTATAAGAAACATAACTGAATATACTACTGAATCATCTAAACCGATTTCTTTTGCTA AATCTTCATTTATAACCATAATTATAACGCTTTTAATTGAATTGACTCTTTAACATTTGATGTTTTAACG AACTGATCGTATATTTCCGGATATTGTTCTTTCAGTGCTTTAGAATCAAGTGATTCACGGCTATACGCTT TCTTCCTTGTGACTGAAATAAGTTCCCCTTTTATATTATCAGCTTTCGCCTCAGACATCAGACCTAACAA CTGTTCTTTGAACTTGCCTAAATGTTCGTCTATCTTCTTTTGCATTTCAAGAAGTTCGTAAACGCCTTCT TCGATATGTGCAACCTTTGCAGGCAACGACTCCAATTTAGCTACATAACTGTCTTTGCTTGCATTGTCTG CATATCGAACTCCATTCTTACAGCAATTAAGGAATAATTCTATTTCGCTGTCCGGTATGCGTTCAACAGA GAAAATTCCGTCCTTATCCTTGTCACCTCTTAGCCAAATTGCGATAAGTCCCTCTACTTTCAAATTTGGG TTTTGTCTCTCGAAAAGATAGGCGTATATTGATAGCTGCCAAGACAAATAAAGCAAATCAAGTTTGTAGG TAGTTTTAATGTCACCTAAAACGACTGATTTATCAGAGCTGCCCAAATATACTTTATCGGTCGGTGATGC GATAAGCTCGTTATCAGTTAGAATATACTCAGATGCGATATGAATTAAACCGCTTCCGGCTTTTAAATTC AAATAGTTCTCTCCGTAGACCGTTTCCGGTTCAATACCTTCTTTGTCGATCCTCTCAACTTCATCATGAA CCGCTTTCCCTCTCTCAGTTGCCGATCTCAAAATATTATCCGGTATATTGTCAAGTTTGCCTGGAAATAA
我想要序列的长度(没有标题).我试过这个：
tail -n +2 my.file | wc -c
这给了我这个输出：
1349
这是错的,实际大小是1330.
我不确定发生了什么事.我想可能有某些隐藏的角色,但我不知道如何探索这个.
这是因为wc也在计算所有的换行符.
您可以使用awk完成此操作：
awk 'NR>1{s+=length()} END{print s}' my.file
1330
你也可以使用tail | tr |厕所：
tail -n +2 my.file | tr -d '\n' | wc -c 1330
